211service.com
Role genetiky ve zdravotních disparitách
V posledním roce došlo k explozi studií spojujících specifické genetické variace s běžnými nemocemi, jako je cukrovka a srdeční choroby. Ale jak časté jsou tyto variace v různých skupinách a hrají stejnou roli v různých populacích? To jsou jen dvě otázky genetického epidemiologa Charles Rotimi si klade za cíl odpovědět jako vedoucí nového centra věnovaného studiu genetiky, životního stylu a nemocí v menšinových skupinách v National Institutes of Health v Bethesdě, MD.
Rasa a medicína: Charles Rotimi, genetický epidemiolog, povede nové centrum v National Institutes of Health pro výzkum nemocí, které neúměrně postihují menšinové skupiny.
Rotimiho výzkum se zaměřil na obezitu, hypertenzi a diabetes – tři poruchy, které neúměrně postihují Afroameričany; dohromady vysoká míra těchto nemocí odpovídá za více než 80 procent zdravotních rozdílů mezi Afroameričany a Evropany. Nové intramurální centrum pro genomiku a zdravotní disparity se pokusí odhalit důvody rozdílů zkoumáním interakcí mezi genetikou a prostředím v afrických a afroamerických populacích. Zatímco mnoho rozdílů je jasně spojeno se socioekonomickými faktory a nedostatečným přístupem k lékařské péči, genetika může také hrát zásadní roli. Například genetická zranitelnost vůči hypertenzi nebo cukrovce se může projevit pouze v prostředí se snadným přístupem k potravinám s vysokým obsahem soli a tuku. Genetické variace mohou také ovlivnit, jak dobře lék funguje, nebo zda způsobí škodlivé vedlejší účinky u pacienta, který jej užívá. Variace se mohou vyskytovat v různých populacích s různou frekvencí – něco, co je třeba vzít v úvahu při studiu a předepisování nových léků.
Recenze technologie nedávno požádal Rotimiho, aby vysvětlil svou práci a její význam.
Recenze technologie : Proč centrum vzniklo?
Charles Rotimi : Jsme přímo v bodě, kdy genomika začíná přinášet zajímavé plody, a chceme vidět tyto plody sdílené všemi populacemi po celém světě. Chceme využít skutečnosti, že děláme značný pokrok v pochopení genetických variací a jak to ovlivňuje distribuci nemocí, které vidíme u různých populací. Pouze zahrnutím všech populací můžeme skutečně pochopit lidské genetické variace a jejich význam pro onemocnění a reakci na léky.
Centrum je zřízeno tak, aby využívalo všech těchto genomických nástrojů a také se snažilo porozumět věcem, jako je kultura a životní styl, a jak interagují s genetikou z hlediska lidských onemocnění. Chceme se konkrétně podívat na nemoci, které neúměrně postihují menšinové skupiny ve Spojených státech, včetně obezity, hypertenze a cukrovky.
Snažíme se pokročit ve výzkumu role kultury, životního stylu a genomiky – nejen genů, ale i interakcí mezi geny a prostředím – abychom nám pomohli porozumět běžným komplexním nemocem. Protože Afrika je původním zdrojem veškeré lidské migrace, cokoliv najdeme, bude informativní pro širokou populaci, nejen pro africký lid.
DĚTI : Myslíte si, že široká veřejnost má mylnou představu o genetice a rase?
ČR : Ano. Mylná představa je, že genetika může být použita k jednoznačné identifikaci všech členů určité rasy ve srovnání s ostatními. I když je pravda, že s dostatkem genetických markerů je možné nakreslit nepřesné hranice, jako jsou Afričané, Evropané a Asiaté, neexistuje žádná sada genetických markerů, které lze použít k identifikaci všech osob, které se identifikují jako příslušníky rasová skupina bez chyby.
Navzdory tomu se vědci ve vědě, medicíně a společnosti nedokázali posunout za hranice rasové kategorizace. Částečně zodpovědnou za naši pokračující posedlost rasou je skutečnost, že ačkoliv nemáme odlišné biologické typy ras, máme rozdíly ve frekvencích genetických markerů napříč skupinami lidských předků. Předpokládá se, že tyto rozdíly, které z větší části popisují geograficky vzdálené populace, skrývají odpovědi na to, proč mohou být někteří jedinci a skupiny náchylnější nebo odolnější vůči nemocem, a mohou být také klíčem k pochopení toho, proč určité skupiny reagují na léky odlišně.
DĚTI : Jsou existující genomické studie neobjektivní?
ČR : Ano. Na Evropanech bylo provedeno obrovské množství velkých genetických studií. Ale centrum jako toto nám pomůže změnit tuto dynamiku tím, že pomůže vytvořit velkou kohortu afroamerické a africké populace.
DĚTI : Proč je tak důležité studovat genetické variace a nemoci u různých populací?
ČR : V souvislosti s běžnými komplexními nemocemi, jako je hypertenze, cukrovka a srdeční onemocnění, geny obvykle nestačí a faktory životního prostředí také nestačí k tomu, aby způsobily onemocnění. Je to kombinace obojího. Interakce mezi geny a prostředím je zvláště důležitá při srovnávání mezi populacemi. Základní genetická varianta může být v obou skupinách stejná, ale faktory prostředí [mohou změnit její dopad]. Řekněme například, že gen A souvisí s hypertenzí, protože reaguje na dietu s vysokým obsahem soli. Pokud je frekvence této genetické varianty u Afroameričanů i Evropanů přibližně stejná, ale Afroameričané jedí více soli, bude pravděpodobnější, že se u nich vyvine hypertenze, a proto budou mít vyšší míru onemocnění.
DĚTI : Jednou z oblastí velké kontroverze v rasové medicíně byl Bidil, lék proti srdečnímu selhání a první léčivo zaměřené výhradně na konkrétní rasovou skupinu – v tomto případě na Afroameričany. V čem vidíte problém s Bidilem?
ČR : Ironií Bidila je, že to nebylo založeno na genetických studiích. Studie se nezabývala žádným konkrétním genem v této skupině zvané Afroameričané. Je důležité, abychom byli schopni porozumět genetice za těmito problémy. Pak se můžeme ptát, kdo z afroamerické a evropské populace má tuto variaci, a tedy schopnost reagovat na konkrétní drogu, nebo potenciál trpět nežádoucím vedlejším účinkem? Už by to nebyl problém skupinové identity.
Část toho, co jsem se snažil udělat, je, že se můžeme unavit ve svém vlastním myšlení a ve způsobech, jak navrhujeme vědecké studie. Například při srovnávání Afroameričanů s jejich evropsko-americkými protějšky je důležité, abychom se kriticky podívali na to, co se děje v západní Africe – původní zdrojové populace Afroameričanů. Většina Afroameričanů sdílí značnou část svého genofondu se Západoafričany – více než 80 procent. Než tedy skupinovým rozdílům připíšete genetické vysvětlení, je důležité porozumět tomu, co se děje ve zdrojové populaci. Například míra hypertenze je asi 7 procent na většině venkova v západní Africe, asi 16 procent v městských centrech, asi 26 procent v černošských zemích v Karibiku a 35 procent mezi Afroameričany. Tyto údaje jasně ukazují důležitost současného prostředí pro prevalenci hypertenze v těchto populacích, které mají velmi nedávné předky.
DĚTI : na čem teď pracuješ?
ČR : Jedna z nejzajímavějších věcí, na kterých pracujeme, je použití čipu Affymetrix 6.0 [genový čip, který dokáže současně detekovat téměř jeden milion specifických genetických variací] ke studiu více než 2 000 Afroameričanů z oblasti Washingtonu, DC. Shromáždili jsme data a brzy zahájíme analýzu; pokud nás nikdo nepřekoná, bude to první celogenomová asociační studie v afroamerické kohortě. Hledáme geny spojené s hypertenzí a obezitou a v budoucnu můžeme hledat geny spojené s cukrovkou.
Také jsme studovali genetiku diabetu v Nigérii, Keni a Ghaně a plánujeme rozšířit tuto kohortu, aby měla dostatečný počet účastníků pro provedení celogenomových asociačních studií.