211service.com
Masivní hledání genů autismu začíná
Hon za genetickým základem autismu se možná brzy přiblíží k nepolapitelnému cíli. Vědci z 11 institucí v oblasti Bostonu, včetně MIT a Broad Institute, použijí nové nástroje k analýze vzorků DNA od tisíců autistů a jejich rodin. Očekává se, že půjde o dosud největší hledání genetických příčin autismu a může přinést kandidátní geny již za šest měsíců.
Identifikace genetických variací, které zvyšují riziko autismu, by mohla vést k novým způsobům léčby této poruchy. (Kredit: Istockphoto.com/mevans)
Tento projekt nám umožní studovat genom s nebývalou úrovní detailů, říká Mark Daly, výzkumník Široký institut kdo se na projektu podílí. Jakmile porozumíme genům a kauzálním cestám, které jsou základem onemocnění, můžeme se zaměřit [na] výzkum a vývoj terapeutik pro tyto geny.
Vědci vědí, že autismus, který se vyskytuje asi u jednoho ze 166 dětí, má genetickou složku; sourozenci autistů mají mnohem vyšší šanci, že se u nich porucha rozvine, než běžná populace. Nemoc má ale pravděpodobně řadu příčin, včetně vlivů prostředí a více genů. Stejně jako u jiných složitých genetických onemocnění bylo určení genů, které zvyšují riziko, nesmírně obtížné.
Předchozí studie identifikovaly velké oblasti genomu, které zřejmě obsahují genetické variace spojené s autismem. Tato oblast však může obsahovat stovky genů a limity technologie analýzy DNA učinily identifikaci konkrétního viníka výzvou. V takových situacích vědci obvykle odhadují na základě známé biologie nemoci. Je to velmi frustrující, říká Rudy tanzi , neurolog na Harvard Medical School a spolupracovník na projektu. Pravděpodobnost, že jste vybrali správný gen, je nízká.
Vědci však nyní mohou skenovat genom mnohem důkladněji pomocí novějších druhů genových čipů, malých sklíček potažených konkrétními sekvencemi DNA, které dokážou identifikovat sekvence ve vzorku tím, že se na ně navážou. Nejnovější čipy dokážou rychle detekovat více sekvencí DNA než kdykoli předtím – stovky tisíc najednou. Nyní můžeme mezi sklem najít diamanty, říká Tanzi.
Nová studie bude používat čip vyvinutý společností Affymetrix , společnost zabývající se analýzou DNA se sídlem v Santa Clara v Kalifornii, která v jediném experimentu vyhledává 500 000 specifických genetických variací neboli SNP (jednonukleotidové polymorfismy). Vědci budou analyzovat DNA 3700 autistů a jejich rodin na SNP, které se objevují častěji u pacientů s touto poruchou ve srovnání s nepostiženými účastníky studie.
Protože čip detekuje tolik SNP, téměř každý může být vysledován na místo blízko nebo v rámci specifického genu v genomu. Každý zásah vás může dostat přímo ke genu, který vás zajímá, říká Tanzi. To je opravdu kvantový skok vpřed, jako přechod z Little League do hlavní ligy.
Jakmile vědci najdou kandidátní seznam genů, což se podle nich může stát již za šest měsíců, zpřístupní data veřejnosti, což umožní dalším vědcům studovat geny a jejich roli v autismu. Odborníci očekávají, že projekt ukáže na geny a cesty, o kterých nikdo u autismu nikdy neuvažoval – cesty, které ve skutečnosti mohou ležet u kořene poruchy.
Studie využívající pokročilé čipy DNA skutečně odhalily překvapivé příčiny jiných nemocí. Podle Dalyho podobná studie věkem podmíněné makulární degenerace (hlavní příčina slepoty u lidí starších 55 let ve Spojených státech) upozornila spíše na geny zapojené do funkce imunitního systému než na geny specifické pro oči nebo mozek. Genetika nás přivedla k biologické cestě, na kterou se lidé nezaměřovali, říká Daly. Poskytuje základ, který umožňuje výzkumné komunitě zaměřit se na to, co je skutečně kauzální, spíše než jen na následek nemoci.
Další plánované nebo probíhající studie využívající nový čip Affymetrix, který byl uveden na trh loni v září, se zaměřují na poruchy včetně cukrovky, obezity a Alzheimerovy choroby. Tanzi již dokončil počáteční analýzu u pacientů s Alzheimerovou chorobou a očekává, že za měsíc bude mít seznam kandidátních genů.
Donutí tedy tyto genové čipy konečně složitá genetická onemocnění, aby se podrobily analýze DNA? Jsem velmi přesvědčen, že najdeme geny spojené se složitými poruchami, říká Daly. Stejně tak jsem přesvědčen, že nenajdeme všechny, možná ani většinu. Ale u neuropsychiatrických poruch, jako je autismus nebo schizofrenie, kde neznáme žádný z genů nebo nemáme žádný přehled o kauzálním základu poruchy, může být odhalení i jediného genu transformační.
Pro ty, kteří čelí každodenním záhadám nemoci, jako je autismus, je to vítaná zpráva. Tohle je opravdu na špici technologie, říká Andy Shih, hlavní vědecký ředitel Autism Speaks, advokátní skupiny se sídlem v New Yorku. Skutečnost, že lidé jsou ochotni aplikovat tuto technologii na autismus, je vzrušující.